آگارز چیست؟ راهنمای خرید آگارز مرک

 آگارز چیست؟

آگارز یک پلی‌ساکارید طبیعی است که از آگار استخراج‌شده از جلبک‌های دریایی قرمز به دست می‌آید. این ماده از واحدهای قندی تکرارشونده تشکیل شده و به دلیل ساختار مولکولی خود، قابلیت تشکیل ژل در محیط آبی را دارد.

آگارز پس از حل‌شدن در بافر و سردشدن، یک شبکه سه‌بعدی متخلخل ایجاد می‌کند. اندازه منافذ این شبکه به عواملی مانند غلظت آگارز و ویژگی‌های ساختاری آن بستگی دارد.

این منافذ به مولکول‌های DNA و RNA اجازه می‌دهند هنگام اعمال میدان الکتریکی از داخل ژل حرکت کنند. قطعات کوچک‌تر معمولاً سریع‌تر از قطعات بزرگ‌تر حرکت می‌کنند؛ به همین دلیل می‌توان قطعات اسید نوکلئیک را بر اساس اندازه تقریبی از یکدیگر جدا کرد.

برای آشنایی بیشتر با ساختار و کاربرد آگارز می‌توانید مشخصات محصول Agarose – Sigma-Aldrich را مطالعه کنید.

مشخصات شیمیایی آگارز

نکته: آگارز یک پلیمر زیستی است و برخلاف ترکیبات شیمیایی کوچک، نباید برای آن یک جرم مولی ثابت و مشخص در نظر گرفت. ویژگی‌های فیزیکی و عملکردی آن با توجه به نوع محصول و گرید متفاوت است.

آگارز چه کاربردهایی دارد؟

مهم‌ترین کاربرد آگارز در آزمایشگاه‌های زیست‌شناسی مولکولی، جداسازی قطعات DNA و RNA است؛ اما این ماده در برخی روش‌های تحقیقاتی و زیست‌فناوری نیز استفاده می‌شود.

۱. الکتروفورز ژل آگارز برای جداسازی DNA

شناخته‌شده‌ترین کاربرد آگارز، استفاده از آن در روش Agarose Gel Electrophoresis است.

در این روش، DNA به دلیل داشتن بار منفی ناشی از گروه‌های فسفات، هنگام اعمال میدان الکتریکی به سمت الکترود مثبت حرکت می‌کند. ژل آگارز مانند یک الک مولکولی عمل می‌کند و حرکت قطعات DNA را بر اساس اندازه آن‌ها تحت تأثیر قرار می‌دهد.

از این روش برای موارد زیر استفاده می‌شود:

• بررسی محصولات واکنش PCR
• ارزیابی DNA استخراج‌شده
• بررسی محصولات هضم آنزیمی DNA
• تخمین اندازه قطعات DNA
• بررسی کیفیت نمونه‌های ژنتیکی
• جداسازی قطعات DNA برای مراحل بعدی آزمایش

برای مطالعه مراحل انجام این روش می‌توانید راهنمای Agarose Gel Electrophoresis در Addgene را ببینید.

۲. بررسی کیفیت و جداسازی RNA

آگارز در بررسی اندازه و یکپارچگی RNA نیز کاربرد دارد. در این روش، نمونه RNA با توجه به نوع آزمایش و شرایط موردنیاز روی ژل قرار می‌گیرد.

از آنجا که RNA می‌تواند ساختارهای ثانویه ایجاد کند، در بسیاری از روش‌های بررسی دقیق آن از شرایط دناتوره‌کننده استفاده می‌شود تا ساختارهای ثانویه بر الگوی مهاجرت مولکول‌ها تأثیر نگذارند.

برای این کاربرد، استفاده از مواد، بافرها و تجهیزات عاری از RNase اهمیت زیادی دارد.

۳. بررسی محصولات PCR

پس از انجام واکنش PCR، معمولاً لازم است محصول تکثیرشده بررسی شود. الکتروفورز ژل آگارز به پژوهشگر کمک می‌کند تا وجود محصول PCR و اندازه تقریبی آن را ارزیابی کند.

با استفاده از DNA Ladder می‌توان اندازه باندهای نمونه را با قطعات استاندارد مقایسه کرد.

۴. بررسی محصولات هضم آنزیمی

در آزمایش‌های مهندسی ژنتیک، آنزیم‌های محدودکننده برای برش DNA در توالی‌های مشخص استفاده می‌شوند. پس از انجام واکنش، می‌توان محصولات حاصل را با استفاده از ژل آگارز بررسی کرد.

این روش برای ارزیابی الگوی برش و مقایسه قطعات DNA کاربرد دارد.

۵. کاربرد در تحقیقات زیست‌فناوری و ژنتیک

آگارز در بسیاری از فعالیت‌های تحقیقاتی مرتبط با ژنتیک، زیست‌شناسی مولکولی، مهندسی ژنتیک و بیوتکنولوژی مورد استفاده قرار می‌گیرد. انتخاب نوع آگارز در این آزمایش‌ها باید بر اساس اندازه قطعات مورد بررسی و حساسیت روش انجام شود.

انواع آگارز آزمایشگاهی

آگارزها بر اساس ویژگی‌های فیزیکی، میزان خلوص و کاربرد موردنظر در گریدهای مختلف تولید می‌شوند. انتخاب نوع مناسب می‌تواند نقش مهمی در کیفیت جداسازی داشته باشد.

۱. آگارز استاندارد (Standard Agarose)

این نوع آگارز برای بسیاری از آزمایش‌های معمول الکتروفورز DNA و RNA استفاده می‌شود. آگارز استاندارد در غلظت‌های مختلف ژل تهیه می‌شود و برای جداسازی طیف وسیعی از قطعات اسید نوکلئیک مناسب است.

۲. آگارز با گرید زیست‌شناسی مولکولی (Molecular Biology Grade)

آگارز گرید Molecular Biology برای کاربردهای حساس‌تر در آزمایشگاه‌های زیست‌شناسی مولکولی طراحی شده است.

در انتخاب این گرید، شاخص‌هایی مانند خلوص، میزان ناخالصی‌های یونی و فعالیت‌های آنزیمی ناخواسته اهمیت دارند.

برای مثال، محصول Agarose با شماره A4718 از Sigma-Aldrich در گرید Molecular Biology عرضه شده و برای الکتروفورز مناسب است. در مشخصات رسمی این محصول، عدم شناسایی فعالیت‌های DNase، RNase و NICKase و مقدار EEO حداکثر 0.05 ذکر شده است.

۳. آگارز با نقطه ذوب پایین (Low Melting Point Agarose)

این نوع آگارز در دمای پایین‌تری نسبت به آگارز معمولی ذوب می‌شود و برای برخی کاربردهای آزمایشگاهی که نیاز به بازیابی قطعات DNA از ژل دارند، مناسب است.

از جمله کاربردهای آن می‌توان به موارد زیر اشاره کرد:

• بازیابی قطعات DNA از ژل
• انجام برخی واکنش‌های آنزیمی درون ژل
• جداسازی و استخراج قطعات بزرگ‌تر اسید نوکلئیک در شرایط مناسب

۴. آگارز با قدرت تفکیک بالا (High Resolution Agarose)

آگارز High Resolution برای جداسازی قطعات DNA کوچک و قطعاتی که اندازه آن‌ها به یکدیگر نزدیک است، استفاده می‌شود.

این نوع آگارز می‌تواند در بررسی محصولات PCR، قطعات کوتاه DNA و برخی مطالعات ژنتیکی کاربرد داشته باشد.

غلظت آگارز در الکتروفورز چه اهمیتی دارد؟

یکی از مهم‌ترین عوامل مؤثر بر کیفیت جداسازی در الکتروفورز، غلظت آگارز در ژل است.

با افزایش غلظت آگارز، اندازه منافذ ژل کاهش پیدا می‌کند و جداسازی قطعات کوچک‌تر DNA معمولاً بهتر انجام می‌شود. در مقابل، غلظت‌های پایین‌تر برای جداسازی قطعات بزرگ‌تر مناسب‌تر هستند.

جدول زیر محدوده‌های تقریبی و رایج را نشان می‌دهد:

غلظت ژل آگارزمحدوده تقریبی قطعات DNA

این مقادیر تقریبی هستند و محدوده تفکیک واقعی به نوع آگارز، بافر، شرایط الکتروفورز و تجهیزات مورد استفاده بستگی دارد.

برای مشاهده راهنمای انتخاب غلظت ژل، می‌توانید به راهنمای QIAGEN درباره آنالیز DNA با ژل مراجعه کنید.

تفاوت آگارز با پلی‌آکریل‌آمید چیست؟

آگارز و پلی‌آکریل‌آمید دو ماده پرکاربرد برای تهیه ژل در روش‌های الکتروفورز هستند؛ اما از نظر ساختار، اندازه منافذ و کاربرد با یکدیگر تفاوت دارند.

ویژگیآگارز (Agarose)پلی‌آکریل‌آمید (Polyacrylamide)

به‌طور کلی، آگارز برای بسیاری از آزمایش‌های معمول DNA انتخاب مناسبی است؛ درحالی‌که پلی‌آکریل‌آمید برای جداسازی دقیق‌تر مولکول‌های کوچک‌تر و کاربردهای خاص استفاده می‌شود.

آگارز مرک چیست؟

آگارز مرک (Merck Agarose) یکی از گزینه‌های قابل بررسی برای آزمایشگاه‌هایی است که به مواد مصرفی با مشخصات فنی و گرید مشخص نیاز دارند.

گروه Merck محصولات متنوعی را در حوزه مواد شیمیایی و علوم زیستی عرضه می‌کند. بخشی از محصولات این مجموعه با برند Sigma-Aldrich ارائه می‌شوند.

یکی از محصولات مرتبط، Agarose با شماره کاتالوگ A4718 است که در صفحه رسمی Sigma-Aldrich با مشخصات زیر معرفی شده است:

نکته مهم: شماره 116802 مربوط به محصول مشخصی از Sigma-Aldrich است. هنگام سفارش، از تطابق شماره کاتالوگ و مشخصات محصول با نیاز آزمایشگاه خود اطمینان حاصل کنید؛ زیرا تمام انواع آگارز مرک ویژگی‌های یکسانی ندارند.

راهنمای خرید آگارز مرک

برای خرید آگارز مرک، صرفاً توجه به نام برند کافی نیست. نوع آزمایش، اندازه قطعات مورد بررسی و حساسیت روش می‌توانند در انتخاب محصول مناسب تأثیرگذار باشند.

۱. مشخص‌کردن کاربرد آزمایشگاهی

ابتدا مشخص کنید آگارز را برای چه کاری نیاز دارید:

• الکتروفورز معمول DNA
• بررسی محصولات PCR
• جداسازی قطعات کوچک DNA
• بررسی کیفیت RNA
• استخراج و بازیابی قطعات DNA از ژل

برای مثال، اگر هدف شما جداسازی قطعات کوچک DNA با وضوح بالا باشد، ممکن است آگارز High Resolution انتخاب مناسب‌تری نسبت به نوع استاندارد باشد.

۲. بررسی گرید محصول

گرید Molecular Biology برای بسیاری از آزمایش‌های زیست‌شناسی مولکولی مناسب است. با این حال، باید مشخصات فنی محصول را بررسی کنید و مطمئن شوید که با الزامات روش آزمایشگاهی شما مطابقت دارد.

۳. توجه به مقدار EEO

EEO یا Electroendosmosis یکی از شاخص‌های مهم در ارزیابی کیفیت آگارز است.

این ویژگی به حرکت مایع درون ماتریس ژل تحت تأثیر گروه‌های باردار مربوط می‌شود و می‌تواند بر کیفیت جداسازی اثر بگذارد. در بسیاری از کاربردهای الکتروفورز، آگارز با EEO پایین ترجیح داده می‌شود.

۴. بررسی خلوص و فعالیت‌های آنزیمی

وجود برخی ناخالصی‌ها یا فعالیت‌های آنزیمی ناخواسته می‌تواند بر نتایج آزمایش تأثیر بگذارد.

در آزمایش‌های حساس DNA و RNA، بهتر است مشخصات مربوط به DNase، RNase و سایر فعالیت‌های ناخواسته در اطلاعات فنی محصول بررسی شود.

۵. بررسی شماره کاتالوگ و مستندات

پیش از خرید آگارز مرک، شماره کاتالوگ، گرید، بسته‌بندی و مشخصات فنی محصول را با صفحه رسمی تولیدکننده تطبیق دهید.

همچنین در صورت نیاز، گواهی آنالیز (COA) و برگه اطلاعات ایمنی (SDS) را بررسی کنید.

۶. استعلام قیمت آگارز مرک

قیمت آگارز مرک به نوع محصول، گرید، وزن بسته‌بندی، موجودی و شرایط تأمین بستگی دارد. به همین دلیل، برای دریافت قیمت دقیق باید شماره کاتالوگ و مقدار موردنیاز مشخص باشد.

خرید آگارز مرک از ایده‌آوران طب پیشتاز

اگر برای آزمایشگاه، مرکز تحقیقاتی یا مجموعه فعال در حوزه بیوتکنولوژی به آگارز نیاز دارید، انتخاب تأمین‌کننده معتبر و بررسی مشخصات محصول اهمیت زیادی دارد.

شرکت ایده‌آوران طب پیشتاز (ATP) در زمینه تأمین مواد شیمیایی و محصولات آزمایشگاهی فعالیت می‌کند و می‌تواند برای استعلام و تهیه محصولات موردنیاز آزمایشگاه‌ها و مراکز تحقیقاتی مورد بررسی قرار گیرد.

برای استعلام خرید آگارز مرک از ایده‌آوران طب پیشتاز با ما در ارتباط باشید.

برای مشاهده محصولات و دریافت اطلاعات بیشتر درباره خدمات تأمین مواد شیمیایی و آزمایشگاهی، به وب‌سایت ایده‌آوران طب پیشتاز مراجعه کنید.

نکات ایمنی و نگهداری آگارز

آگارز معمولاً به شکل پودر عرضه می‌شود و هنگام کار با آن باید اصول ایمنی آزمایشگاهی رعایت شود.

• از ایجاد و استنشاق گردوغبار پودر جلوگیری کنید.
• هنگام توزین و آماده‌سازی محلول از دستکش و عینک ایمنی استفاده کنید.
• برای حل‌کردن آگارز، محلول را طبق پروتکل آزمایشگاه گرم کنید و از خطر سوختگی ناشی از محلول داغ آگاه باشید.
• محصول را در شرایط توصیه‌شده توسط سازنده نگهداری کنید.
• از ورود رطوبت و آلودگی به بسته‌بندی جلوگیری کنید.
• برای انتخاب شرایط نگهداری دقیق، برگه SDS و اطلاعات رسمی همان محصول را مطالعه کنید.

پرسش‌های متداول درباره آگارز

۱. آگارز چیست و چه کاربردی دارد؟

آگارز یک پلی‌ساکارید طبیعی استخراج‌شده از جلبک‌های دریایی است که به دلیل توانایی تشکیل ژل، در آزمایشگاه‌های زیست‌شناسی مولکولی برای جداسازی DNA و RNA به روش الکتروفورز استفاده می‌شود.

۲. شماره CAS آگارز چند است؟

شماره CAS آگارز 9012-36-6 است. این شناسه برای شناسایی ماده در پایگاه‌های اطلاعاتی شیمیایی و مستندات محصولات آزمایشگاهی استفاده می‌شود.

۳. شماره کاتالوگ آگارز مرک چیست؟

یکی از محصولات آگارز عرضه‌شده در مجموعه متعلق به گروه Merck با کد 116802میباشد. 

۴. تفاوت آگارز معمولی با آگارز Low Melting Point چیست؟

آگارز معمولی برای بسیاری از آزمایش‌های الکتروفورز استفاده می‌شود؛ اما آگارز Low Melting Point در دمای پایین‌تری ذوب و ژل می‌شود و برای برخی کاربردهای استخراج DNA و واکنش‌های آنزیمی درون ژل مناسب است.

۵. قیمت آگارز مرک چقدر است؟

قیمت آگارز مرک به گرید، شماره کاتالوگ، وزن بسته‌بندی و شرایط تأمین بستگی دارد. برای اطلاع از قیمت روز، بهتر است شماره محصول و مقدار موردنیاز را مشخص کرده و از تأمین‌کننده استعلام بگیرید.

۶. برای الکتروفورز DNA چه نوع آگارزی مناسب است؟

انتخاب آگارز به اندازه قطعات DNA و وضوح موردنیاز بستگی دارد. برای بسیاری از آزمایش‌های معمول، آگارز استاندارد یا گرید Molecular Biology مناسب است؛ اما برای جداسازی قطعات کوچک و نزدیک به هم ممکن است نوع High Resolution عملکرد بهتری داشته باشد.

جمع‌بندی

آگارز یکی از مواد ضروری در بسیاری از آزمایشگاه‌های زیست‌شناسی مولکولی و ژنتیک است که به دلیل قابلیت تشکیل ژل، برای جداسازی و بررسی DNA و RNA به روش الکتروفورز استفاده می‌شود.

انتخاب آگارز مناسب به عواملی مانند گرید، خلوص، میزان EEO، اندازه قطعات مورد بررسی و نوع آزمایش بستگی دارد. 

محصولات Merck از جمله آگارز با کد 116802 از گزینه‌های قابل بررسی برای کاربردهای تخصصی آزمایشگاهی هستند.

اگر قصد خرید آگارز مرک را دارید، پیشنهاد می‌شود پیش از سفارش، شماره کاتالوگ و مشخصات فنی محصول را با نیاز آزمایشگاه تطبیق دهید و برای استعلام موجودی و قیمت روز از تأمین‌کنندگان معتبر مانند ایده‌آوران طب پیشتاز اقدام کنید.

منابع :

1. Merck / Sigma-Aldrich – Agarose A4718, Molecular Biology
2. Merck – Nucleic Acid Electrophoresis Protocols
3. Thermo Fisher Scientific – Steps in Nucleic Acid Gel Electrophoresis
4. Addgene – Agarose Gel Electrophoresis Protocol
5. QIAGEN – DNA Analysis Using Analytical Gels
6. PubChem – Agarose Substance Information

خرید آگارز مرک قیمت آگارز مرک آگارز مرک Agarose Merck Agarose Sigma Aldrich شماره CAS آگارزشماره کاتالوگ آگارزکاربرد آگارز انواع آگارز آگارز گرید Molecular Biology آگارز الکتروفورزژل آگارز الکتروفورز DNA الکتروفورز RNA خرید مواد شیمیایی آزمایشگاهی خرید مواد آزمایشگاهی از ایده آوران طب پیشتاز

خرید آگارز مرک قیمت آگارز مرک آگارز مرک Agarose Merck Agarose Sigma Aldrich شماره CAS آگارزشماره کاتالوگ آگارزکاربرد آگارز انواع آگارز آگارز گرید Molecular Biology آگارز الکتروفورزژل آگارز الکتروفورز DNA الکتروفورز RNA خرید مواد شیمیایی آزمایشگاهی خرید مواد آزمایشگاهی از ایده آوران طب پیشتاز